Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf8Q60846 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf8Q60846 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf8Q60846 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf8Q60846 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf8Q60846 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf8Q60846 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf8Q60846 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf8Q60846 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms