Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r1bQ60829 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp1r1bQ60829 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms