Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfkbibQ60778 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfkbibQ60778 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms