Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmelQ60696 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmelQ60696 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmelQ60696 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmelQ60696 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PmelQ60696 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PmelQ60696 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmelQ60696 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmelQ60696 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmelQ60696 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmelQ60696 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PmelQ60696 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmelQ60696 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms