Protein–RNA interactions for Protein: Q60687

Fshb, Follitropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FshbQ60687 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FshbQ60687 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FshbQ60687 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FshbQ60687 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FshbQ60687 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FshbQ60687 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FshbQ60687 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FshbQ60687 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms