Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema5bQ60519 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema5bQ60519 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema5bQ60519 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms