Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd5Q5VCS6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd5Q5VCS6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd5Q5VCS6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms