Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E0

Lhfpl4, LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl4Q5U4E0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhfpl4Q5U4E0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl4Q5U4E0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms