Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc5a6Q5U4D8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms