Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NotoQ5TIS6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NotoQ5TIS6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NotoQ5TIS6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms