Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Brip1Q5SXJ3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brip1Q5SXJ3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms