Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zzef1Q5SSH7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zzef1Q5SSH7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Zzef1Q5SSH7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zzef1Q5SSH7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zzef1Q5SSH7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zzef1Q5SSH7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Zzef1Q5SSH7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zzef1Q5SSH7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zzef1Q5SSH7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zzef1Q5SSH7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zzef1Q5SSH7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zzef1Q5SSH7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms