Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf215Q5SPX3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf215Q5SPX3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf215Q5SPX3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf215Q5SPX3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf215Q5SPX3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf215Q5SPX3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf215Q5SPX3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf215Q5SPX3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf215Q5SPX3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf215Q5SPX3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf215Q5SPX3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms