Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps54Q5SPW0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vps54Q5SPW0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps54Q5SPW0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms