Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brsk1Q5RJI5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brsk1Q5RJI5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brsk1Q5RJI5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Brsk1Q5RJI5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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