Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg7Q5RJH6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smg7Q5RJH6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg7Q5RJH6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
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