Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlha9Q5RJB0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlha9Q5RJB0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms