Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rtp3Q5QGU6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rtp3Q5QGU6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms