Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scarf1Q5ND28 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scarf1Q5ND28 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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