Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CoblQ5NBX1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CoblQ5NBX1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms