Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CenpjQ569L8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CenpjQ569L8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CenpjQ569L8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms