Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig2Q52KR2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrig2Q52KR2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms