Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccnl1Q52KE7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccnl1Q52KE7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccnl1Q52KE7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccnl1Q52KE7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms