Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brinp3Q499E0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms