Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd5Q3V1H9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd5Q3V1H9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms