Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppp4r3cQ3V0Y1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppp4r3cQ3V0Y1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppp4r3cQ3V0Y1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms