Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Garnl3Q3V0G7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Garnl3Q3V0G7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms