Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rimbp3Q3V0F0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rimbp3Q3V0F0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rimbp3Q3V0F0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms