Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4933416C03RikQ3V063 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933416C03RikQ3V063 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933416C03RikQ3V063 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms