Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc160Q3UYG1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc160Q3UYG1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc160Q3UYG1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms