Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5aQ3UXZ9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm5aQ3UXZ9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm5aQ3UXZ9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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