Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms