Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Prom2Q3UUY6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prom2Q3UUY6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prom2Q3UUY6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prom2Q3UUY6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prom2Q3UUY6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms