Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28047Q3US59 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm28047Q3US59 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28047Q3US59 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms