Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQU0

Brd9, Bromodomain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd9Q3UQU0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brd9Q3UQU0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd9Q3UQU0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd9Q3UQU0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd9Q3UQU0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd9Q3UQU0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd9Q3UQU0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd9Q3UQU0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd9Q3UQU0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd9Q3UQU0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd9Q3UQU0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd9Q3UQU0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd9Q3UQU0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd9Q3UQU0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd9Q3UQU0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd9Q3UQU0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd9Q3UQU0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd9Q3UQU0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd9Q3UQU0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms