Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec31aQ3UPL0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sec31aQ3UPL0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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