Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMT1

Ppp1r12c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12cQ3UMT1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms