Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cog7Q3UM29 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms