Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UJP5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJP5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3UJP5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3UJP5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UJP5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3UJP5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UJP5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms