Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp19Q3UJD6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp19Q3UJD6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp19Q3UJD6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms