Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Greb1Q3UHK3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Greb1Q3UHK3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms