Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed8Q3UHI4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed8Q3UHI4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed8Q3UHI4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed8Q3UHI4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed8Q3UHI4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed8Q3UHI4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed8Q3UHI4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed8Q3UHI4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmed8Q3UHI4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed8Q3UHI4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms