Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zswim8Q3UHH1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zswim8Q3UHH1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms