Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6cQ3UHC0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Tnrc6cQ3UHC0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms