Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc177Q3UHB8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc177Q3UHB8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc177Q3UHB8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms