Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsph3aQ3UFY4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rsph3aQ3UFY4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3aQ3UFY4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms