Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Carmil3Q3UFQ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Carmil3Q3UFQ8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil3Q3UFQ8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil3Q3UFQ8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil3Q3UFQ8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil3Q3UFQ8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil3Q3UFQ8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil3Q3UFQ8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil3Q3UFQ8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil3Q3UFQ8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil3Q3UFQ8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil3Q3UFQ8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Carmil3Q3UFQ8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Carmil3Q3UFQ8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Carmil3Q3UFQ8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms