Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nom1Q3UFM5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nom1Q3UFM5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nom1Q3UFM5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nom1Q3UFM5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nom1Q3UFM5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nom1Q3UFM5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nom1Q3UFM5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nom1Q3UFM5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nom1Q3UFM5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nom1Q3UFM5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nom1Q3UFM5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nom1Q3UFM5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nom1Q3UFM5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nom1Q3UFM5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nom1Q3UFM5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nom1Q3UFM5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nom1Q3UFM5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nom1Q3UFM5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nom1Q3UFM5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nom1Q3UFM5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms