Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trafd1Q3UDK1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trafd1Q3UDK1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trafd1Q3UDK1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trafd1Q3UDK1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trafd1Q3UDK1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trafd1Q3UDK1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trafd1Q3UDK1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trafd1Q3UDK1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trafd1Q3UDK1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trafd1Q3UDK1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trafd1Q3UDK1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trafd1Q3UDK1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trafd1Q3UDK1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trafd1Q3UDK1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms