Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atxn7l3bQ3UD01 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atxn7l3bQ3UD01 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atxn7l3bQ3UD01 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms